Beberapa aspek kerja sama Indonesia dan Amerika Serikat di antaranya politik dan keamanan: peningkatan hubungan militer dan kerja sama dalam bidang penanggulangan terorisme dan kejahatan transnasional. Semantara di sektor ekonomi: AS merupakan salah satu mitra dagang utama bagi Indonesia.
Kedua negara memiliki kerja sama dalam berbagai sektor ekonomi, seperti energi, pertanian, investasi, dan perdagangan. AS juga merupakan investor besar di Indonesia, dan banyak perusahaan AS yang beroperasi di Indonesia. Kedua negara telah menandatangani perjanjian perdagangan, seperti Generalized System of Preferences (GSP), yang memberikan preferensi tarif bagi produk Indonesia di pasar AS.